https://doi.org/10.1590/1982-0224-2023-0025
https://www.scielo.br/j/ni/a/dQrF3xsJNC ... M/?lang=en
Keywords: Markers; Mitochondrial DNA; Molecular identification; Phylogenetic analysisAbstract
The complete mitogenome of four populations distributed along the species natural range was reconstructed, comprising the first study with this genus and the second with Corydoradinae specimens sampled from their natural environment and deposited in permanent collections. The mitogenome of S. barbatus is a circular molecule of 16,694 base pairs (bp) comprising 37 genes, 22 of which are tRNA, two are rRNA, 13 are protein-coding genes and one control region (D-loop). An 18-nucleotide insertion sequence was found between the ATPase subunit 6 and COIII genes. Most genes are encoded on the heavy strand, while the ND6 and eight tRNAs are found on the light strand. Phylogenetic analyses using other available Callichthyidae mitogenomes confirmed the monophyly of Callichthyinae and Corydoradinae and indicate that S. barbatus populations form a separate and more closely related branch of Corydoras nattereri + Corydoras paleatus.
Palavras chave: Análises filogenéticas; DNA Mitocondrial; Identificação molecular; MarcadoresResumo
O mitogenoma completo de quatro populações de Scleromystax barbatus coletadas ao longo da área de distribuição natural foi reconstruído, compreendendo o primeiro estudo com este gênero e o segundo com espécimes de Corydoradinae amostrados em seu ambiente natural e depositados em coleções permanentes. O mitogenoma de S. barbatus é uma molécula circular de 16.694 pares de bases (pb) compreendendo 37 genes, dos quais 22 são tRNA, dois são rRNA, 13 são genes codificadores de proteínas e uma região controle (D-loop). Uma sequência de inserção de 18 nucleotídeos foi encontrada entre a subunidade 6 da ATPase e os genes COIII. A maioria dos genes é codificada na fita pesada, enquanto o ND6 e oito tRNAs são encontrados na fita leve. Análises filogenéticas usando outros mitogenomas de Callichthyidae disponíveis confirmaram a monofilia de Callichthyinae e Corydoradinae e indicam que as populações de S. barbatus formam um ramo separado e mais intimamente relacionado a Corydoras nattereri + Corydoras paleatus.